記者從西南大學(xué)資源昆蟲(chóng)高效養(yǎng)殖與利用全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室獲悉，實(shí)驗(yàn)室代方銀教授團(tuán)隊(duì)取得最新科研成果——“數(shù)字家蠶”共享分析平臺(tái)，對(duì)于推動(dòng)家蠶泛基因組成果在功能基因組、基因組選擇和分子設(shè)計(jì)育種等方面的研究應(yīng)用具有重要意義。相關(guān)研究成果近日在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《核酸研究》在線發(fā)表。

在現(xiàn)代蠶學(xué)研究和育種實(shí)踐中，泛基因組序列和多組學(xué)數(shù)據(jù)已經(jīng)成為科學(xué)家手中不可或缺的基礎(chǔ)資源，可以縮短研究和育種的時(shí)間，顯著提高工作效率。然而，多組學(xué)大數(shù)據(jù)的整合分析和使用具有成本高、技術(shù)難度大的特點(diǎn)。

代方銀介紹，分析平臺(tái)不僅涵蓋家蠶基因序列信息，還整合了家蠶基因表達(dá)、調(diào)控、功能研究等數(shù)據(jù)，提供了開(kāi)展比較基因組和功能基因組等方面研究的分析工具。

Δ“數(shù)字家蠶”共享分析平臺(tái)數(shù)據(jù)和功能示意圖。（受訪者供圖）

這是繼2022年該團(tuán)隊(duì)發(fā)布家蠶超級(jí)泛基因組圖譜后，推動(dòng)創(chuàng)建“數(shù)字家蠶”取得的又一重大進(jìn)展。分析平臺(tái)整合了家蠶泛基因組序列及多組學(xué)數(shù)據(jù)，將一個(gè)具有上千個(gè)種質(zhì)資源的線下實(shí)體基因資源庫(kù)轉(zhuǎn)化為組學(xué)序列數(shù)據(jù)庫(kù)并搬上互聯(lián)網(wǎng)，實(shí)現(xiàn)種質(zhì)資源基因組、遺傳變異及表型等數(shù)據(jù)的開(kāi)放共享和可視化分析。

“我們將它比喻為一部智能、高效的家蠶基因‘?dāng)?shù)字字典’或超級(jí)‘圖書(shū)館’，研究人員能在這里快速獲取家蠶基因組相關(guān)信息?！蔽髂洗髮W(xué)資源昆蟲(chóng)高效養(yǎng)殖與利用全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室博士后陸昆鵬說(shuō)。

來(lái)源：新華網(wǎng)